Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYB561P49447 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYB561P49447 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYB561P49447 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms