Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTRNP46939 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UTRNP46939 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
UTRNP46939 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UTRNP46939 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
UTRNP46939 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UTRNP46939 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UTRNP46939 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTRNP46939 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UTRNP46939 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTRNP46939 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms