Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms