Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms