Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms