Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMB9P28065 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms