Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms