Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms