Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA1P25391 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA1P25391 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms