Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
S100A1P23297 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
S100A1P23297 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
S100A1P23297 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
S100A1P23297 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
S100A1P23297 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
S100A1P23297 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
S100A1P23297 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
S100A1P23297 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
S100A1P23297 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
S100A1P23297 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms