Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms