Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms