Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPEP16870 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CPEP16870 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPEP16870 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPEP16870 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPEP16870 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms