Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms