Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms