Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms