Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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