Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms