Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPN1P04843 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPN1P04843 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPN1P04843 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPN1P04843 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPN1P04843 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPN1P04843 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPN1P04843 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms