Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC1P02654 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms