Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F9P00740 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F9P00740 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F9P00740 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
F9P00740 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F9P00740 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F9P00740 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F9P00740 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F9P00740 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F9P00740 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms