Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGFRP00533 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EGFRP00533 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1
EGFRP00533 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EGFRP00533 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EGFRP00533 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGFRP00533 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGFRP00533 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EGFRP00533 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms