Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX7O95931 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX7O95931 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX7O95931 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX7O95931 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX7O95931 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX7O95931 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX7O95931 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX7O95931 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms