Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMTA2O94983 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms