Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms