Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX3O75364 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX3O75364 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX3O75364 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms