Protein–RNA interactions for Protein: O60353

FZD6, Frizzled-6, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD6O60353 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD6O60353 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD6O60353 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD6O60353 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD6O60353 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD6O60353 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD6O60353 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD6O60353 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD6O60353 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD6O60353 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD6O60353 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD6O60353 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD6O60353 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD6O60353 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD6O60353 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD6O60353 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD6O60353 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD6O60353 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD6O60353 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD6O60353 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD6O60353 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD6O60353 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD6O60353 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD6O60353 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms