Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCL13O43927 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms