Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1O43719 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms