Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF13O43567 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF13O43567 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF13O43567 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF13O43567 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF13O43567 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF13O43567 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF13O43567 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms