Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF3O43395 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms