Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRTM2O43300 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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