Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLRMTO00411 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLRMTO00411 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms