Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCER2I3L3R5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms