Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms