Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVV-1B6SEH8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms