Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms