Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms