Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms