Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF316A6NFI3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms