Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms