Protein–RNA interactions for Protein: A6BM72

MEGF11, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF11A6BM72 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MEGF11A6BM72 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms