Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EFCAB5A4FU69 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms