Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NRXN3Q9Y4C0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRXN3Q9Y4C0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms