Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms