Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRAP3Q9Y2W1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms