Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms