Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM2AQ9Y2K7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms