Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC2Q9Y235 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms