Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms